Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS3AP61247 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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