Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB8AP61006 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB8AP61006 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms