Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ACTBP60709 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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ACTBP60709 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ACTBP60709 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ACTBP60709 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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