Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms