Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms