Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms