Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GDF10P55107 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GDF10P55107 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms