Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGS4P49798 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms