Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJA8P48165 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJA8P48165 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJA8P48165 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJA8P48165 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJA8P48165 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 973.7 ms