Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMPOP42166 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMPOP42166 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms