Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms