Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN2P35609 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.1 ms