Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms