Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA3P35244 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPA3P35244 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms