Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTNNB1P35222 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms