Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP1P29466 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP1P29466 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP1P29466 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP1P29466 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms