Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLD1P28340 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLD1P28340 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms