Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPREP23469 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPREP23469 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPREP23469 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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