Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD58P19256 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD58P19256 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD58P19256 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD58P19256 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD58P19256 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD58P19256 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD58P19256 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD58P19256 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD58P19256 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms