Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPN1P18031 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms