Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XBP1P17861 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XBP1P17861 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XBP1P17861 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms