Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA1P17302 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GJA1P17302 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms