Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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