Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRAFP15056 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms