Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHAP12694 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms