Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms