Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSCO60682 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSCO60682 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSCO60682 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSCO60682 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSCO60682 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSCO60682 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSCO60682 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSCO60682 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSCO60682 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSCO60682 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSCO60682 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms