Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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