Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRKAB2O43741 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKAB2O43741 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms