Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT4C9JH25 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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