Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSDA5PKW4 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms