Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms