Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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