Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MED16Q9Y2X0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MED16Q9Y2X0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms