Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEU3Q9UQ49 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms