Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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COPS3Q9UNS2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS3Q9UNS2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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COPS3Q9UNS2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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COPS3Q9UNS2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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COPS3Q9UNS2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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COPS3Q9UNS2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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COPS3Q9UNS2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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