Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PADI4Q9UM07 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 555.3 ms