Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC23Q9UJX2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms