Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPC1L1Q9UHC9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms