Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH3Q9UHC1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms