Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRBP1Q9P2E9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms