Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CIPCQ9C0C6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms