Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FOXQ1Q9C009 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXQ1Q9C009 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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