Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR2

KRTAP4-5, Keratin-associated protein 4-5, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP4-5Q9BYR2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms