Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms