Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
COL25A1Q9BXS0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL25A1Q9BXS0 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms