Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRRTQ9BXP5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRRTQ9BXP5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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