Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD11Q9BXL7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD11Q9BXL7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms