Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VN1R3Q9BXE9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms