Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms